Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef17A2ASJ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms