Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtf1A2AQ19 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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