Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms