Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syndig1A2ANU3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms