Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hmcn2A2AJ76 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Hmcn2A2AJ76 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hmcn2A2AJ76 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms