Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ambra1A2AH22 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ambra1A2AH22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms