Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprfA2A8L5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PtprfA2A8L5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PtprfA2A8L5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PtprfA2A8L5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms