Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb4A2A863 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms