Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l1A2A259 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms