Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms