Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms