Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv21A0A0A6YX06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv21A0A0A6YX06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Trbv21A0A0A6YX06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Trbv21A0A0A6YX06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv21A0A0A6YX06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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