Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ctf2-201ENSMUST00000076091 1754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33630-201ENSMUST00000223038 2071 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 4930444M15Rik-201ENSMUST00000181972 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2i-212ENSMUST00000174001 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3093-201ENSMUST00000175247 87 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21832-201ENSMUST00000186439 691 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21573-201ENSMUST00000190112 691 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC140409.1-202ENSMUST00000216792 432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28453-202ENSMUST00000185975 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zeb2-214ENSMUST00000177302 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms