Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5114W4VSN8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms