Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Crlf3Q9Z2L7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Crlf3Q9Z2L7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms