Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Krt16Q9Z2K1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt16Q9Z2K1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms