Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms