Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms