Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr4Q9Z1L2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr4Q9Z1L2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms