Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms