Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi4Q9Z183 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi4Q9Z183 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms