Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms