Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn1Q9Z0I7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms