Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clip2Q9Z0H8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Clip2Q9Z0H8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip2Q9Z0H8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms