Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0D9

Cx3cr1, CX3C chemokine receptor 1, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cr1Q9Z0D9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cx3cr1Q9Z0D9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cx3cr1Q9Z0D9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cx3cr1Q9Z0D9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cx3cr1Q9Z0D9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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