Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pmfbp1Q9WVQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms