Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf103Q9R1W3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf103Q9R1W3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms