Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms