Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Taf7Q9R1C0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf7Q9R1C0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf7Q9R1C0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms