Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hsf4Q9R0L1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hsf4Q9R0L1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms