Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha15Q9QYC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha15Q9QYC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha15Q9QYC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms