Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VapbQ9QY76 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms