Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxnb3Q9QY40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxnb3Q9QY40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms