Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxe3Q9QY14 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms