Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fscn3Q9QXW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fscn3Q9QXW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fscn3Q9QXW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fscn3Q9QXW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fscn3Q9QXW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fscn3Q9QXW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms