Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms