Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf3Q9QXK7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf3Q9QXK7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf3Q9QXK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cpsf3Q9QXK7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms