Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms