Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc5Q9QX29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms