Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms