Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reep6Q9JM62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms