Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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