Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gde1Q9JL56 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms