Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms