Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms