Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms