Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms