Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms