Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Tmod2Q9JKK7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Tmod2Q9JKK7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Tmod2Q9JKK7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod2Q9JKK7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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