Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nectin1Q9JKF6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms